<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 3.2//EN">
<HTML>
<HEAD>
<META HTTP-EQUIV="Content-Type" CONTENT="text/html; charset=us-ascii">
<META NAME="Generator" CONTENT="MS Exchange Server version 6.0.6603.0">
<TITLE>fail to run parallel jobs thru PBS</TITLE>
</HEAD>
<BODY>
<!-- Converted from text/rtf format -->

<P><FONT FACE="Tahoma">Dear all,</FONT>
</P>

<P><FONT FACE="Tahoma">I run molpro job thru PBS like following:</FONT>
</P>

<P><FONT FACE="Tahoma">--------------------------------------------</FONT>

<BR><FONT COLOR="#008000" FACE="Courier New">#!/bin/bash</FONT>

<BR><FONT COLOR="#008000" FACE="Courier New">#PBS -q   q4n16g</FONT>

<BR><FONT COLOR="#008000" FACE="Courier New">#PBS -N   test4n</FONT>

<BR><FONT COLOR="#008000" FACE="Courier New">#PBS -lnodes=4:ppn=2</FONT>

<BR><FONT COLOR="#008000" FACE="Courier New">#PBS -m   bea</FONT>
</P>

<P><FONT COLOR="#008000" FACE="Courier New">cd /tmp/molpro/demo</FONT>

<BR><B><FONT COLOR="#008000" FACE="Courier New">/usr/local/bin/molpro -v -g -o 1-methyl-cis-radical.8.out 1-methyl-cis-radical.in</FONT></B>

<BR><FONT FACE="Tahoma">--------------------------------------------</FONT>
</P>

<P><FONT FACE="Tahoma">but got following error:</FONT>
</P>

<P><FONT FACE="Tahoma">--------------------------------------------</FONT>

<BR><FONT FACE="Courier New">It appears that tasks allocated on the same host machine do not have</FONT>

<BR><FONT FACE="Courier New">consecutive message-passing IDs/numbers. This is not acceptable </FONT>

<BR><FONT FACE="Courier New">to the ARMCI library as it prevents SMP optimizations and would</FONT>

<BR><FONT FACE="Courier New">lead to poor resource utilization.</FONT>
</P>

<P><FONT FACE="Courier New">Please contact your System Administrator or, if you can, modify the TCGMSG</FONT>

<BR><FONT FACE="Courier New">message-passing job startup configuration.</FONT>
</P>

<P><FONT FACE="Courier New">0:Cannot run: improper task to host mapping!: 0</FONT>

<BR><FONT FACE="Tahoma">--------------------------------------------</FONT>
</P>

<P><FONT FACE="Tahoma">Found that PBS assign jobs "alternatively", e.g. on 2 2-cpu nodes, jobs are run in this order: A,B,A,B.   Seems Molpro jobs running on the same node must have consecutive message-passing ID.  I wonder if this is the cause.  Is there there is any solution ?</FONT></P>

<P><FONT FACE="Tahoma">Thanks a lot.</FONT>

<BR><FONT FACE="Tahoma">Best Regards,</FONT>

<BR><FONT FACE="Tahoma">ST Wong</FONT>
</P>
<BR>
<BR>
<BR>
<BR>
<BR>

</BODY>
</HTML>