<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
<style type="text/css" style="display:none;"><!-- P {margin-top:0;margin-bottom:0;} --></style>
</head>
<body dir="ltr">
<div id="divtagdefaultwrapper" style="font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Calibri,Helvetica,sans-serif,"EmojiFont","Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols;" dir="ltr">
<p></p>
<div>Dear Molpro Users,<br>
<br>
I'm having some trouble getting molpro to run in parralel properly and was hoping someone could help.<br>
<br>
The Problem:<br>
 Specifically, when i run molpro with multiple cores it gives a lot of indications thats its running in parralel but my jobs get no real time speedup (in fact they often take longer when run in parralel).<br>
<br>
For example running (on a cluster) "molpro -n -v $cores input_file.in" for this input_file.in:<br>
<br>
"memory,700,m <br>
GDIRECT<br>
symmetry,nosym<br>
{basis set info removed to save space}<br>
{Geometry removed removed to save space}<br>
{rhf}"<br>
<br>
leads to Real times of 7575.33/6218.91/6029.07 seconds for 12/4/1 cores  respectively (i.e more cores=slower).<br>
<br>
Relevant (i think) info:<br>
I'm using Molpro Version 2015.1 and submitting with this PBS script:<br>
<br>
"# batch processing commands<br>
#PBS -l walltime=04:00:00<br>
#PBS -lselect=1:ncpus=4:mpiprocs=4:mem=22000MB:tmpspace=400000MB<br>
#PBS -j oe<br>
#PBS -q pqmaterials<br>
#PBS -m n<br>
<br>
/home/rf614/MolPro/bin/molpro -n ${core} -d $TMPDIR -W $TMPDIR -v $PBS_O_WORKDIR/${in} > $TMPDIR/$cust_error_file"<br>
<br>
Note changing either ncpus or mpiprocs to 1 leads to the serial code being used.<br>
<br>
The verbose option in molpro leads to the following information being printed(for the 4 core job):<br>
 # PARALLEL mode, HOST=cx1-130-5-20<br>
 nodelist=4<br>
 first   =4<br>
 second  =<br>
 third   =<br>
 HOSTFILE_FORMAT: $hostname<br>
<br>
cx1-130-5-20.cx1.hpc.ic.ac.uk<br>
cx1-130-5-20.cx1.hpc.ic.ac.uk<br>
cx1-130-5-20.cx1.hpc.ic.ac.uk<br>
cx1-130-5-20.cx1.hpc.ic.ac.uk<br>
<br>
        LD_LIBRARY_PATH=''<br>
 export AIXTHREAD_SCOPE='s'<br>
 export MOLPRO_PREFIX='/export131/home/rf614/MolPro/install'<br>
 export MP_NODES='0'<br>
 export MP_PROCS='4'<br>
        MP_TASKS_PER_NODE=''<br>
 export MOLPRO_NOARG='1'<br>
 export MOLPRO_OPTIONS=' -d /var/tmp/pbs.165647.cx1 -W /var/tmp/pbs.165647.cx1 -v /work/rf614/Post_Doc/molpro_tests/cpu_time_tests/SPE_Only/pentacene_GP_PBE_TDDFT_ccpvdz_molpro_4core.com -t 4'<br>
        MOLPRO_OPTIONS_FILE=''<br>
        MPI_MAX_CLUSTER_SIZE=''<br>
        MV2_ENABLE_AFFINITY=''<br>
 export RT_GRQ='ON'<br>
 export TMPDIR='/var/tmp/pbs.165647.cx1'<br>
 export XLSMPOPTS='parthds=4'<br>
/export131/home/rf614/MolPro/install/bin/mpiexec.hydra -machinefile /var/tmp/pbs.165647.cx1/procgrp.25439 -np 4 /export131/home/rf614/MolPro/install/bin/molpro.exe  -d /var/tmp/pbs.165647.cx1 -W /var/tmp/pbs.165647.cx1 -v /work/rf614/Post_Doc/molpro_tests/cpu_time_tests/SPE_Only/pentacene_GP_PBE_TDDFT_ccpvdz_molpro_4core.com
 -t 4<br>
 token read from /export131/home/rf614/MolPro/install/lib//.token<br>
<br>
I'd appreciate any help/suggestions to solve this.<br>
Thanks in advance<br>
Richard<br>
<br>
</div>
<p></p>
</div>
</body>
</html>