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<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal">I am having trouble with the memory needed for these calcs. (input below)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">With 1000 MW it gets as far as <o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">PROGRAM * CCSD (Closed-shell coupled cluster)    <o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">CCSD-F12 implementation by  H.-J. Werner, 2007<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">Basis set JKFIT generated for VTZ, H=VTZ. Number of basis functions:   714
<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"> Basis set JKFIT2 generated for VTZ, H=VTZ. Number of basis functions:   714
<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"> Basis set MP2FIT generated for AVTZ, H=VTZ. Number of basis functions:   876<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">but then crashes<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">=   BAD TERMINATION OF ONE OF YOUR APPLICATION PROCESSES<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">=   EXIT CODE: 9<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">with lesser amounts it goes further <o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"> Basis set JKFIT generated for VQZ, H=VQZ. Number of basis functions:   1044
<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"> Basis set JKFIT2 generated for VQZ, H=VQZ. Number of basis functions:   1044
<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"> Basis set MP2FIT generated for AVQZ, H=VQZ. Number of basis functions:   1448<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">but then  <o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"> Catastrophic lack of memory in transformation<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">Increase memory by at least 206.25 and for optimum performance by 3302.28 Mwords.<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">What should I be specifying?<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">And when I switch over to running a similar sized job but serial Molpro/MRCC ?
<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">===========================<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">***, cyclopentanone <o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">Memory,1000,M;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">Set,Charge=0,Spin=0;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">Geomtyp=xyz;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">Geometry={<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">14            <o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">Cyclopentanone<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">H ,   0.4054200816 , -2.046488933 , 0.4985141709<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">C ,   0.0294140857 , -1.2335257733 , -0.1204619155<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">C ,   -1.3797308956 , -0.7378990966 , 0.2247966432<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">C ,   -1.3797536681 , 0.7379046205 , -0.2246882777<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">C ,   0.0294219955 , 1.2335262929 , 0.1204460599<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">C ,   0.9242435976 , 0.0000073971 , -0.0001047261<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">H ,   0.0865384242 , -1.5703245682 , -1.1606018022<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">H ,   -1.5395964884 , -0.7942378098 , 1.304118975<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">H ,   -2.1681732698 , -1.3204161553 , -0.2493660473<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">H ,   -1.5397200223 , 0.7942492872 , -1.3039953377<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">H ,   -2.1681515356 , 1.3204180498 , 0.2495528267<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">H ,   0.0866583704 , 1.5702594582 , 1.1606012785<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">H ,   0.4053536094 , 2.0465306538 , -0.4985207898<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">O ,   2.1283827155 , -0.0000006685 , -0.0000580577}<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">Basis={<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">Default=AVTZ,H=VTZ;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">}<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">RHF;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">CCSD(T)-F12;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">method(1)='HF(CABS)     7-TZ';<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">method(2)='CCSD-F12b    7-TZ';<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">method(3)='CCSD(T)-F12b 7-TZ';<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">e(1)=energr;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">e(2)=energc(2);<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">e(3)=energy(2);<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">Basis={<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">Default=AVQZ,H=VQZ;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">}<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">RHF;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">CCSD-F12;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">method(4)='HF(CABS)     7-QZ';<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">method(5)='CCSD-F12b    7-QZ';<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">e(4)=energr;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">e(5)=energy(2);<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">Basis={<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">Default=cc-pCVTZ;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">spd,H,cc-pVTZ;c;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">spf,C,cc-pCVTZ;c;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">spf,N,cc-pCVTZ;c;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">spf,O,cc-pCVTZ;c;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">d,C,cc-pCVQZ;c;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">d,N,cc-pCVQZ;c;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">d,O,cc-pCVQZ;c;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">}<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">RHF;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">MP2;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">method(6)='MP2          CVTZ(3d)';<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">e(6)=energy;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">DKroll=1;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">RHF;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">{MP2;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">Core;}<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">method(7)='MP2(CR)      CVTZ(3d)';<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">e(7)=energy;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">Basis={<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">Default=cc-pCVDZ;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">sp,H,cc-pVDZ;c;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">sp,C,cc-pCVDZ;c;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">sp,N,cc-pCVDZ;c;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">sp,O,cc-pCVDZ;c;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">d,C,cc-pCVTZ;c;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">d,N,cc-pCVTZ;c;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">d,O,cc-pCVTZ;c;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">}<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">DKroll=0;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">RHF;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">CCSD(T);<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">method(8)='MP2          CVDZ(2d)';<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">method(9)='CCSD(T)      CVDZ(2d)';<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">e(8)=emp2;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">e(9)=energy;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">DKroll=1;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">RHF;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">{CCSD(T);<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">Core;}<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">method(10)='MP2(CR)      CVDZ(2d)';<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">method(11)='CCSD(T)(CR)  CVDZ(2d)';<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">e(10)=emp2;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">e(11)=energy;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">ehf=e(4);<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">ecc=(e(5)-e(4))-((e(5)-e(4))-(e(2)-e(1)))*4^-5.8769/(4^-5.8769-3^-5.8769);<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">e_t=(e(3)-e(2))*1.0607;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">ecr=(e(7)-e(6))*1.1383+((e(11)-e(9))-(e(10)-e(8)))*1.5577;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">method(12)='W2X              ';<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">e(12)=ehf+ecc+e_t+ecr;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">table,method,e;<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">---<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">=============================================<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">System used:<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">an SGI ICE X system of 320 nodes or 7680 cores made of 2.4GHz Intel Ivy Bridge cores.
<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">Each node has 2x12 core processors, 64GB of RAM and is connected using FDR InfiniBand.
<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">This amounts to 20TB of RAM across the partition.<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">==============================================<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">Typically 24 cores for a walltime of 144 hours<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-IE">Prof. John M. Simmie::Combustion Chemistry Centre<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-IE">                         NUI Galway::Ireland<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Arial",sans-serif;color:#222222;background:white;mso-fareast-language:EN-IE">                   Mo sh¨ile togam suas</span><span style="mso-fareast-language:EN-IE"><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
</body>
</html>